Фамилия Клокоцкий — редкий случай, когда географическая привязка к одному месту оказывается надёжнее, чем разбор прозвища. Её основа — топоним Клокотка, Клокотки или Клокоцк. Такие названия встречаются в Беларуси и на востоке Польши, в регионе, который исторически был частью Речи Посполитой. Например, деревня Клокотка есть в Гродненской области. Житель такой местности, переезжая в другое село или город, получал прозвание «Клокоцкий» — по названию покинутого места. Типичная модель для фамилий на -ский, которые в XVI–XVIII веках активно формировались у шляхты и зажиточных крестьян на западнорусских землях.

Слово «клокот» в старом русском и украинском языке означало шум, грохот, клокотание — звук кипящей воды или бурлящего потока. Поэтому исходный топоним мог быть дан речке или ручью с быстрым течением. Если же отталкиваться от прямого прозвища, то Клокотом в народе могли назвать крикливого, шумного человека. Но версия с географическим названием выглядит убедительнее: фамилий на -ский, образованных от гидронимов, в этом регионе гораздо больше, чем прозвищных.

Суффикс -цк- (вместо более частого -ск-) — особенность, указывающая на мягкую основу исходного слова: Клокотка → Клокоцкий. Такая замена «тк» на «цк» характерна для белорусской и польской фонетики. В русских фамилиях на -ский подобное встречается реже, так что написание Клокоцкий, а не Клокотский — верный признак западного происхождения.

Сословно фамилия не привязана к одному классу. В актах XIX века Клокоцкие встречаются и среди православной шляхты Минской губернии, и среди мещан, и среди крестьян. В советское время фамилия оставалась редкой — по переписи 2020 года в России её носит около 500–600 человек, сконцентрированных в основном в Брянской и Смоленской областях, то есть на границе с Беларусью.