Фамилия Клопины — одна из тех, где прозвище предка напрямую перешло в наследственное имя. В основе лежит слово «клоп». Обычно так называли человека невысокого роста, но прозвище могло относиться и к характеру: Клопом дразнили надоедливого, сварливого, приставучего человека. Оба значения бытовали в русских говорах, и сейчас уже невозможно точно сказать, какое из них стало причиной именно для вашей ветви рода.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к прозвищу Клоп добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Клопин сын). Такая модель была особенно распространена в северных и центральных областях России, а также в Сибири, куда переселенцы приносили свои прозвища. Встречаются и однокоренные фамилии — Клопов, Клопков, Клопотенко, но Клопины выделяются именно суффиксом -ин, который старше и архаичнее, чем -ов.

В документах фамилия фиксируется с XVI века. В переписных книгах Новгорода и Пскова упоминаются крестьяне и посадские люди с таким прозвищем. Позже, в XVIII–XIX веках, Клопины встречаются среди однодворцев южных губерний — потомков служилых людей, охранявших границы государства. Это значит, что предки носителей фамилии могли быть не только крестьянами, но и мелкими землевладельцами или военными поселенцами.

Не стоит связывать фамилию с насекомым в бытовом смысле: прозвище давали не за связь с паразитами, а за внешность или поведение. В русской ономастике такие «насекомые» фамилии — обычное дело (Жуков, Мухин, Осипов), и Клопины стоят в том же ряду, но с более яркой, конкретной характеристикой человека.