Фамилия Клопский — одна из тех, где внешне очевидное значение обманчиво. На первый взгляд кажется, что в основе лежит прозвище от насекомого — клопа. Такая версия существует, но она далеко не единственная и, скорее всего, не главная.

Фамилия образована по модели типичной для духовенства: суффикс -ский указывает на принадлежность к месту или монастырю. В ономастике хорошо известно, что фамилии на -ский (Клопский, Троицкий, Знаменский) часто давались семинаристам по названию их прихода или обители. В данном случае речь идёт о Никольском Клопском монастыре под Новгородом, который был основан преподобным Михаилом Клопским. Монастырь стоял на реке Веряже, в урочище Клопско — отсюда и название. Скорее всего, предок носителя фамилии либо был родом из этих мест, либо учился в семинарии при монастыре и получил фамилию по месту службы.

Версия с прозвищем «Клоп» тоже имеет право на существование, но она менее вероятна для такой фамильной модели. Прозвища от насекомых в русском языке были (Жук, Блоха, Комар), однако они обычно давали фамилии без суффикса -ский: Клопов, Клопин. Форма Клопский — это признак книжного, искусственного происхождения, а не уличного прозвища. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подчёркивается, что фамилии духовенства на -ский часто связаны с топонимами, а не с бытовыми прозвищами.

Таким образом, Клопский — фамилия с географическим корнем, а не с «насекомым». Носители её, скорее всего, потомки церковнослужителей или выходцев из Новгородской губернии, где находился Клопский монастырь. Фамилия редкая, и в отличие от массовых Клоповых, она сохраняет прямую привязку к конкретному историческому месту.