Фамилия Клоповский по своему происхождению — типичная «географическая» фамилия, образованная по модели, популярной среди польской и западнорусской шляхты. Суффикс -ский указывает на связь с местностью: так называли человека, владевшего землей или жившего в населенном пункте с названием вроде Клопово, Клопов, Клоповка. Подобных сел и деревень на территории бывшей Речи Посполитой, а также в центральной России было немало, и большинство из них получили имя от прозвища или фамилии первопоселенца Клоп.

Основа фамилии — слово «клоп» — в русском языке имеет не только прямое значение (насекомое), но и переносное, прозвищное. В старину клопом могли назвать невысокого, юркого человека или того, кто вел себя назойливо, «прилипчиво». Однако у прозвища мог быть и более безобидный смысл: в некоторых говорах «клопом» называли ребенка, который постоянно спит рядом с матерью, или просто ласковое прозвище для маленького. Фамилии Клопов, Клоповский нередко встречаются в среде духовенства — семинаристам часто давали фамилии по названиям животных и насекомых, причем без уничижительной окраски, скорее как формальный признак.

Стоит обратить внимание на то, что в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще носили крестьяне и горожане, фамилия Клоповский по суффиксу тяготеет к дворянскому или шляхетскому кругу. В документах XIX века носители этой фамилии встречаются среди мелкопоместных дворян Витебской, Могилевской и Киевской губерний, а также среди униатского и православного духовенства. Это делает фамилию характерной для западных регионов Российской империи, где польская ономастическая модель смешивалась с русской.

Встречается также вариант написания Клаповский — через «а», что может быть связано с акающим произношением или с иной топонимической основой (например, от слова «клап» — лоскут, обрывок в польском языке). Но основная, наиболее частая форма — именно Клоповский, и ее корень лежит в прозвище или названии места, а не в прямом указании на насекомое.