Фамилия Клос чаще всего указывает на польские корни. Её происхождение сводят к двум основным версиям, и обе имеют равное право на существование. Первая версия связывает фамилию с личным именем: Клос — это краткая, обиходная форма имени Николай. Само имя Николай греческого происхождения (от «nika» — побеждать и «laos» — народ), а в польской традиции его часто сокращали до Клос, подобно тому как в русском языке используют Коля.

Вторая версия отталкивается от прозвища. Польское слово «kłos» означает «колос». В этом случае прозвище Клос мог получить крестьянин или землепашец — по роду занятий, либо человек с высоким ростом и стройной фигурой, которую сравнивали с колосом. Такие прозвища, образованные от названий растений, были распространены в славянской среде.

Суффикса в фамилии нет — она сохранила исходную польскую форму без русификации. В России и Украине фамилия встречается реже, чем в Польше, и часто сохраняет написание через «К» (Клос), а не через «Х» (Хлос), что также указывает на западное, а не немецкое происхождение. С точки зрения словообразовательной модели, это типичная «прозвищная» фамилия, которая закрепилась без дополнительных окончаний, характерных для восточнославянских фамилий на -ов или -ин.

Редкий суффикс и отсутствие типичного русского окончания делают фамилию Клос заметной: носитель такой фамилии почти наверняка имеет предков из Польши или западнорусских земель, находившихся под польским влиянием.