Фамилия Клуса — редкая и неоднозначная по происхождению. В её основе лежит прозвище Клус, а вот что оно означало, можно только гадать, причём версии довольно разные. По словарю Владимира Даля, «клус» — это шут, гаер, паяц, клоун, то есть проказник и забавник. Если так, то фамилию дали предку-весельчаку, балагуру, который умел рассмешить окружающих. Но есть и другой вариант: в костромских говорах бытовало наречие «клусно» — странно, дико, чудно. Тогда Клусом могли прозвать человека, который вёл необычный, отличный от других образ жизни, возможно, чудака или отшельника.

Третья гипотеза уводит нас в литовский язык, где слово klusus означает «чуткий, обладающий тонким слухом». В этом случае прозвище мог получить человек с отличным музыкальным слухом — например, певчий или музыкант. Какая из версий правдоподобнее — сказать трудно, но все три имеют право на существование и показывают, насколько разными могли быть люди, носившие это прозвище.

Сама фамилия Клуса — по сути, застывшая форма прозвища без типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Такая модель встречается реже и указывает на то, что фамилия могла оформиться поздно или под влиянием других языков. Судя по сохранившимся записям, носители фамилии жили на стыке культур — в Белоруссии, Латвии, Сибири. В Книге памяти Республики Беларусь упомянут Клус Алексей Устинович, 1908 года рождения, из деревни Пони Виленской губернии. В Книге памяти Красноярского края значится Клус Иосиф Петрович (1910 г.р.) с хутора Кудринка в Енисейской губернии. А в Книге памяти Жамбылской области записан помощник машиниста Клус Сельвестр Петрович (1894 г.р.), живший в латвийском селе Костюки. Эти разрозненные данные намекают на то, что фамилия бытовала в западных губерниях Российской империи, а затем вместе с переселенцами ушла в Сибирь и Среднюю Азию.