Фамилия Клюшинцов — редкий пример, где суффикс указывает на социальный статус предка точнее, чем основа. Словообразовательная модель здесь двуступенчатая: от прозвища или имени Клюша (или Клюш) через отчество Клюшин к «служилому» суффиксу -цов. Именно суффикс -цов, а не более привычные -ов или -ин, и дает ключ к разгадке. В русской ономастике такие фамилии (на -цов, -ев) часто встречались у детей боярских, дворян и служилых людей, особенно на южных и восточных окраинах Московского государства, где в XVI–XVII веках фиксировали целые роды по отцу и деду с добавлением «-цов» для отличия от однофамильцев. То есть Клюшинцов — это не просто «сын Клюшина», а потомок человека, которого в официальных документах записывали как Клюшин сын, а затем закрепили полную форму.

Основа фамилии — Клюша. Это древнерусское нецерковное имя или прозвище. Наиболее вероятное значение связано с клюкой, посохом, кривой палкой: «клюша» в диалектах означало человека согбенного, хромого или того, кто ходит с опорой. В новгородских и псковских говорах «клюша» — также неуклюжий, неловкий человек. Встречается и другая версия: от глагола «клюшить» (кривить, гнуть) или от названия птицы клуши (чайки), но первая, прозвищная, выглядит убедительнее — такие имена давали по внешним признакам.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основные очаги — Тверская, Псковская и Новгородская области, что подтверждает северо-западное происхождение прозвища. Встречается также в южных регионах (Воронежская, Ростовская области), куда фамилия могла попасть вместе со служилыми людьми при освоении «Дикого поля» в XVII веке. Вариант написания с «ц» (Клюшинцов, а не Клюшинцев) — не ошибка, а архаичная форма, сохранившаяся в старых переписях; в современных документах встречаются оба написания, но исходная форма на «-цо» (Клюшинцо) как топоним или прозвище не зафиксирована.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Клюшин, Клюшников, Клюшниченко — то Клюшинцов стоит особняком: он не от профессии (клюшник — слуга при клюке, посохе) и не от украинской модели, а от отчества с двойным патронимическим суффиксом. Это делает фамилию маркером определенного сословия и территории: предок, скорее всего, был не крестьянином, а мелким служилым человеком, чью родословную записывали с особой тщательностью.