Фамилия Клюшун — яркий пример того, как прозвище, данное человеку по его поведению или занятию, превратилось в родовое имя. В её основе лежит глагол «клюшить» или существительное «клюша», которые в русских говорах имели несколько значений. Самое вероятное из них — «ходить вразвалку, неуклюже», «ковылять» или «плестись». Соответственно, Клюшуном могли прозвать медлительного, неповоротливого человека или того, кто прихрамывал. Менее распространённая, но тоже возможная версия отсылает к диалектному слову «клюша» — так в некоторых областях называли кочергу или клюку, палку с загнутым концом. В этом случае прозвище мог получить либо кузнец, изготавливавший такие предметы, либо пастух, пользовавшийся посохом.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна для русской традиции. Обычно фамилии образуются с помощью суффиксов -ов, -ин, -ский. Здесь же мы видим редкий суффикс -ун, который в русском языке чаще встречается в именах нарицательных (болтун, говорун, скакун). В фамилиях он фиксирует прозвище по характерному действию или свойству, как, например, в фамилиях Болтунов, Говорунов. Таким образом, Клюшун — это «тот, кто клюшит», то есть обладает названной особенностью. Замена фамильного суффикса на -ов здесь не произошла, что указывает на более позднее и, возможно, украинское или белорусское происхождение, где такие «голые» прозвищные фамилии встречаются чаще.

Географически фамилия редкая и в основном встречается в южнорусских и украинских регионах, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В письменных источниках XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и казаков с таким прозвищем, что говорит о её простонародных корнях. Дворянских родов Клюшун не зафиксировано. В современной России фамилия сохраняется, но остаётся малочисленной. Носителям стоит знать, что их фамилия несёт не столько профессиональный, сколько описательный, «прозвищный» отпечаток, и её значение уходит корнями в бытовую речь и наблюдательность предков.