Фамилия Клюйбина — это, в первую очередь, женская форма фамилии Клюйбин, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. Основа фамилии — прозвище или мирское имя Клюйба. Чтобы понять его смысл, нужно заглянуть в старые русские говоры. Глагол «клюйбать» или «клюбать» в некоторых диалектах означал «клевать», «долбить», «стучать». Следовательно, Клюйбой могли прозвать человека с характерной привычкой — например, того, кто говорил отрывисто, «клевал» носом во время работы или, напротив, был настойчивым и «долбил» одно и то же.

Словообразовательная модель проста и типична для русского севера и центральных областей. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Клюйбин — это «сын Клюйбы» или «человек из рода Клюйбы». Такая форма характерна для фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. В отличие от фамилий на -ов (Иванов, Петров), суффикс -ин чаще встречается в северных и вологодских землях, где была сильна традиция именовать по отцу с этим окончанием.

Интересно, что у фамилии есть и менее очевидная, но возможная версия. Корень «клюй» мог быть связан с названием птицы — клюй (старое диалектное название дятла). В таком случае Клюйба — это прозвище по профессии или внешности: плотника, столяра, который «долбит» дерево, как дятел, или же человека с длинным носом. Ономастика знает много примеров, когда птичьи прозвища становились фамилиями (Соколов, Воробьёв, Дятлов), и Клюйбин в этом ряду — редкий, но органичный вариант.

В документах фамилия встречается крайне редко. Основной ареал её бытования — Вологодская область и прилегающие районы Архангельской губернии, что подтверждает северное происхождение. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти крестьян с прозвищем Клюйба, но в фамилию оно оформилось, скорее всего, позже, уже в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по имени или прозвищу отца.

Таким образом, Клюйбин — это не фамилия знатного рода, а типичное крестьянское прозвание, возникшее из живого народного языка. Носитель этой фамилии может считать своим предком человека с острым языком, настойчивого работника или, возможно, мастера по дереву. Спор о точном значении корня (от действия или от птицы) остаётся открытым, но обе версии рисуют образ живого, деятельного человека из русской деревни.