Фамилия Кмиссаров — один из тех случаев, когда написание скрывает живую разговорную историю. На слух она звучит как «комиссаров», и именно так её чаще всего произносили. Но на письме закрепилась форма без первой «о»: Кмиссаров. Это не ошибка, а отражение акающего произношения — в южнорусских и некоторых центральных говорах безударное «о» редуцировалось до «а», а затем и вовсе выпадало. Так «Комиссаров» превратилось в «Кмиссаров». Подобные фонетические варианты встречаются и у других фамилий на -ов, например, Кзаринов (от Казаринов) или Кшевский (от Кошевский).

По сути, перед нами та же фамилия, что и Комиссаров. Её основа — слово «комиссар», которое в русский язык пришло из немецкого (Kommissar) или напрямую из латыни через польское посредство. В допетровской Руси комиссарами называли должностных лиц, ведавших сбором налогов или снабжением войск. Позже, в XVIII–XIX веках, так именовали чиновников особых поручений, а в советское время слово получило широкое распространение. Однако фамилия Кмиссаров, скорее всего, сформировалась задолго до революции: модель «профессия + -ов» типична для XVI–XVII веков, когда прозвище или должность отца переходила к детям как наследственное имя рода. Носитель фамилии мог быть либо самим комиссаром, либо, что вероятнее, его сыном, внуком или служилым человеком, приписанным к комиссарству.

Встречается и другая, менее очевидная версия: происхождение от редкого нецерковного имени или прозвища Кмисс. Но в исторических документах такое имя не зафиксировано, а все известные случаи бытования фамилии Кмиссаров тяготеют к югу России и Украине — регионам, где аканье и выпадение гласных особенно сильны. Поэтому связь с «комиссаром» остаётся основной и наиболее правдоподобной.

С точки зрения словообразования фамилия проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?» — Кмиссаров). Ударение, как и в исходном слове, падает на второй слог: Кми́ссаров. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка происходил из служилой или мещанской среды, а не из крестьянской глуши, где должности комиссаров были редкостью.