Фамилия Коботова — женская форма фамилии Коботов, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени предка-мужчины. Основа «Кобот» в русских говорах имеет несколько значений, и чтобы понять, откуда пошла фамилия, нужно разобраться в диалектной лексике.

Самая вероятная версия связывает фамилию со словом «кобот» — так в некоторых регионах (особенно в северных и сибирских говорах) называли короткую верхнюю одежду, род безрукавки или кафтана. В этом случае Коботов — сын человека, который либо шил такую одежду, либо постоянно её носил, либо получил прозвище за какую-то особенность, связанную с ней. Модель образования проста: к основе «Кобот» добавили типичный русский суффикс принадлежности -ов, указывающий на родство («чей?» — Коботов).

Менее распространённая, но тоже возможная версия — от глагола «коботиться», что значит «суетиться, хлопотать, беспокоиться». В таком случае прозвище Кобот могли дать человеку беспокойному, непоседливому или чрезмерно заботливому. Этот корень встречается и в других однокоренных фамилиях — Коботов, Коботков, Коботкин, что подтверждает его живую основу в народной речи.

Фамилия Коботова не относится к числу широко распространённых. В исторических документах она не фиксируется так часто, как фамилии от церковных имён или распространённых ремёсел. Это говорит о том, что её носители могли происходить из крестьянской или мещанской среды, где прозвища бытовали долго и не всегда попадали в официальные переписи. Суффикс -ов, а не -ин, указывает на то, что основа не была личным именем, оканчивающимся на -а или -я, а именно прозвищем или нарицательным словом мужского рода.

Таким образом, предки Коботовых, скорее всего, жили в северной или центральной части России, занимались крестьянским трудом или ремеслом, а прозвище их родоначальника было связано либо с одеждой, либо с характером.