В основе фамилии Кочунова лежит имя Кочун, которое происходит от корня «кече» - «солнце». У многих народов солнце почиталось как божество. А потому нарекая своего ребёнка именем Кочун, родители, возможно, надеялись на то, что солнце будет покровительствовать их сыну. Менее вероятно, что в основе фамилии Кочунова лежит тюркское имя Кочун, данное по названию персидского города Кочун (другие его названия - Кочан и Хабушан). Также не исключено, что фамилия Кочунова образована от прозвища Кочун, связанного со славянским глаголом «кочевать». В этом случае Кочуном могли называть того, кто часто менял место жительства.