Фамилия Кофанов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Скорее всего, фамилия Кофанов образована от украинского прозвища Кохан – «любимый, милый». В переходных говорах от русского языка к украинскому звуки «х» и «ф» смешиваются и взаимно заменяют друг друга. Такая ситуация типична для русифицированных украинских фамилий. Менее вероятно, что в основе этой фамилии лежит название племени эквадорских индейцев – кофанов. Существует и такая версия: эта фамилия образована от турецкого слова kofana – «мелкая рыба, похожая на сельдь», либо от kofa – «тростник». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кохан, со временем получил фамилию Кофанов. О точном месте и времени возникновения фамилии Кофанов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Кофанов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.