Фамилия Колмыгин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, в её основе лежит прозвище или профессия, а не имя в крестильном календаре. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Колмыгин — это «сын Колмыги» или «человек из семьи Колмыги».

Самая прямая версия отсылает к слову «колмыга». В русских говорах так называли большую неуклюжую шапку, меховой треух, а также нечто громоздкое и несуразное. Прозвище Колмыга могли дать человеку, который постоянно носил такую шапку, или же, в переносном смысле, медлительному, неповоротливому мужчине. Фамилия образовалась по простой модели: прозвище → отчество (Колмыгин сын) → фамилия.

Есть и более прозаичная, но не менее вероятная гипотеза: связь с ремеслом. В некоторых диалектах «колмыжить» означало мять, комкать, сбивать в кучу. Это могло относиться к работе с кожей или шерстью — например, к валяльщику войлока или скорняку, который сбивал мех. В этом случае фамилия была бы профессиональной, обозначая род занятий предка.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Архангельской, Вологодской, Костромской. Именно там слово «колмыга» в значении «шапка» было в ходу. В южных говорах оно не встречается, что делает версию с прозвищем более локальной и конкретной.

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к слову «калмык» (этноним). Разница в корне: в «Колмыгине» — корень «колм-», а в «Калмыкове» — «калм-». Это разные ономастические гнёзда, хотя из-за созвучия их иногда путают. Написание с буквой «о» в первом слоге закрепилось исторически и не является ошибкой.

Таким образом, носитель фамилии Колмыгин, скорее всего, ведёт род от человека, которого в деревне прозвали за его шапку или за манеру одеваться, либо от мастера по обработке шерсти или кожи. Обе версии укладываются в бытовую логику русских прозвищ XV–XVII веков.