Фамилия Колмынин — типичный пример русского «отчества» на -ин, но с неочевидной основой. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Колмынин буквально означает «сын Колмыны» или «человек из рода Колмыны». Вопрос в том, что скрывается за этим словом.

Самая прямая версия — происхождение от прозвища или имени Колмына. В русских говорах «колмы́га» или «колмы́к» могли называть неповоротливого, неуклюжего человека, либо того, кто ходит вперевалку. В словаре Даля зафиксирован глагол «колмы́житься» — капризничать, упрямиться. Если прозвище дали по характеру, то Колмыной могли прозвать сварливого или привередливого человека. Вторая, более спорная версия — связь с этнонимом «калмык». Однако фонетика тут работает против: в фамилии корень «колм-», а не «калм-». Скорее всего, это народное переосмысление, когда редкое местное прозвище позже стали сближать с названием калмыцкого народа, но исходно слова разные.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодчине, Костромской, Нижегородской губерниям. В этих краях слово «колмыга» бытовало именно в значении «неповоротливый человек» или «колода, чурбан» (переносно). Модель образования на -ин, а не на -ов, тоже косвенно указывает на северное или владимирское происхождение: в этих регионах притяжательные прилагательные от прозвищ на -а/-я чаще давали фамилии на -ин.

Интересная деталь: фамилия Колмынин могла возникнуть и от женского имени или прозвища Колмына. В русской традиции XV–XVII веков женщину могли назвать по её поведению, а дети получали отчество от материнского прозвища — такое случалось, если отец был неизвестен или мать играла главную роль в хозяйстве. Полной уверенности в этой версии нет, но она объясняет, почему основа заканчивается на -а, а не на твёрдый согласный.

Таким образом, предки носителей фамилии Колмынин — скорее всего, крестьяне или посадские люди из северной или центральной России. Прозвище Колмына давалось либо за медлительность и тяжеловесность, либо за упрямый нрав. Дворянских корней у фамилии не прослеживается — в родословных книгах она не встречается, что подтверждает её простонародное происхождение.