Фамилия Колмынина образована по одной из самых распространённых моделей в русском языке: от основы через суффикс -ин, который указывает на принадлежность. Буквально Колмынина — «дочь или жена Колмынина». Мужская форма — Колмынин. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Колмыня, и именно в нём скрыта главная загадка фамилии.

Самый очевидный путь — связать Колмыню с этнонимом «калмык». В русских говорах слово «колмык» (с «о») фиксировалось как обозначение не только представителя народа, но и, в переносном смысле, человека с раскосыми глазами, смуглого, или просто того, кто одет или ведёт себя не по-деревенски, «по-калмыцки». Прозвище Колмыня могли дать за внешность или за привычку носить, скажем, меховую шапку-ушанку летом. Фонетический переход «калмык» → «колмык» для северных и центральных говоров нормален: аканье здесь не было всеобщим, а «о» в первом слоге — результат диалектного произношения или старого написания.

Менее вероятна, но возможна версия от тюркского имени собственного. У татар и башкир встречается имя Колмынбай, где «колмын» может восходить к «калмык» или к другому корню. Но если фамилия исконно русская, что подтверждается суффиксом -ин, то основа — скорее прозвище, чем заимствованное имя.

Географически фамилия Колмынина не привязана к Поволжью или Калмыкии, как можно подумать. По данным переписей и современных справочников, она встречается в основном на Русском Севере, в Вологодской и Архангельской областях, а также в Сибири, куда северян переселяли. Это косвенно подтверждает прозвищное, а не этническое происхождение: на Севере калмыков не было, но прозвище по внешнему сходству дать могли.

Фамилия редкая, недворянская. Носители, скорее всего, из крестьян или посадских людей. В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьянина Колмыню из Тотемского уезда — это и есть та основа, от которой пошла фамилия. Если вы ищете своих предков, стоит начинать с Вологодчины и архивов северных монастырей, где велись подробные переписи.