Фамилия Колубанова — женская форма фамилии Колубанов, и её разбор стоит начать с неочевидной, но показательной детали: суффикс -анов в русских фамилиях встречается реже, чем привычные -ов или -ин. Он указывает на то, что основа фамилии — не просто имя или прозвище, а слово, которое могло оканчиваться на -ан или -ань. В фамилии Колубанов корень «колуб-» выглядит как искажённое или диалектное «голуб-»: замена начального «г» на «к» — распространённое явление в южнорусских и некоторых белорусских говорах (ср. «колубка» вместо «голубка»). Таким образом, наиболее вероятная версия: Колубанов — это вариант фамилии Голубанов, то есть образованной от прозвища или имени Голубан.

Прозвище Голубан (или Колубан) в старину могли дать человеку за мягкий, мирный нрав, за любовь к голубям или даже за профессию — голубятника. В ономастике встречается и другая версия: связь с диалектным словом «колуб» — «клубок» или «свёрток» (в некоторых говорах так называли моток пряжи). Тогда Колубан — прозвище мастера, который сматывал нитки, или человека сутулого, «свёрнутого». Но эта гипотеза слабее: фамилии от названий ремёсел с суффиксом -ан встречаются редко, а вот патронимическая модель (от личного прозвища) — типична.

С точки зрения географии, фамилия Колубанов тяготеет к центральным и южным областям России, особенно к Тамбовской, Воронежской и Рязанской губерниям — именно там фиксируются ранние упоминания однокоренных фамилий. В дореволюционных метрических книгах Колубановы встречаются среди крестьян и мещан, то есть фамилия недворянская, а народная, возникшая в среде простых людей. Суффикс -ов указывает на стандартную модель образования русских фамилий в XVI–XVII веках: «чей?» — Колубанова сына, то есть потомка человека по прозвищу Колубан.

Интересно, что в современных базах фамилия Колубанов встречается редко, а её женская форма Колубанова — ещё реже. Это не массовая фамилия, а локальная, что только подтверждает её происхождение от конкретного прозвища в одном или нескольких сёлах. Если сравнивать с однокоренными — Голубанов, Голубан, Колупанов (последняя, кстати, от другого корня — «колупать»), — то Колубанов стоит особняком именно из-за фонетического сдвига, который мог возникнуть из-за аканья или местного произношения.