Фамилия Комариков образована от прозвища Комар. Вопреки возможному ожиданию, это не обязательно было обидное прозвище для маленького или надоедливого человека. В старину комар — символ настойчивости, боевитости, умения «пропищать» своё. Прозвище Комар мог получить крикливый, приставучий или, наоборот, худой и вертлявый человек. В псковских и новгородских говорах «комара» называли ещё и человека маленького роста, но с громким голосом.

Суффикс -ик- в основе (Комар → Комарик) указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму прозвища. Это характерно для фамилий, которые закрепились в крестьянской среде: сначала человека звали Комар, а затем, в быту, его могли называть Комарик — особенно если речь шла о молодом парне или невысоком мужчине. Фамилия Комариков — типичная русская патронимическая модель на -ов, то есть «сын Комарика». Такие фамилии массово оформлялись в XVI–XVII веках, когда крестьяне и посадские люди получали фамилии по имени или прозвищу отца.

Интересная деталь: фамилия Комариков встречается заметно реже, чем Комаров, и это говорит о её локальном бытовании. Если Комаров — одна из самых распространённых «насекомых» фамилий России, то Комариков — её уменьшительный вариант, закрепившийся, скорее всего, в центральных и северных губерниях. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Комарик, но в фамилию оно перешло не везде.

Словарь русских фамилий (например, работы Б. Унбегауна) относит такие фамилии к группе «натуральных» — образованных от названий животных, птиц и насекомых. Однако в отличие от фамилий типа Волков или Медведев, где прозвище часто давали за сходство с крупным зверем, Комариков могло закрепиться за человеком с яркой, «кусачей» речью или за тем, кто работал в болотистой местности и славился тем, что его не берёт комарьё — то есть был привычен к гнусу.