Фамилия Комарныцкая — женская форма фамилии Комарныцкий, и её разбор стоит начать с суффикса, который сразу указывает на географическое происхождение. Окончание -цк- (в мужском варианте -ский) в русских и украинских фамилиях не случайно: оно образовывалось от названий мест, часто сёл или городов. Так, основа «Комарны» или «Комарное» — это типичное название населённого пункта, которое встречается в западных регионах Украины и в Польше. Например, существует село Комарны (пол. Komarno) во Львовской области, а также несколько деревень с похожими названиями на Волыни и в Беларуси. Таким образом, предок носительницы фамилии, скорее всего, был выходцем из такого места — его прозвали «комарныцкий», то есть «тот, кто из Комарного».

Сам корень «комар» прозрачен: он восходит к названию насекомого. Но в данном случае фамилия не прозвищная (не «человек, похожий на комара»), а топонимическая. В польской и украинской ономастике фамилии на -ский/-цкий традиционно принадлежали шляхте и духовенству, однако к XVIII–XIX векам их активно перенимали и крестьяне, и мещане, особенно при записи в метрические книги. Поэтому утверждать, что Комарныцкие — обязательно дворяне, нельзя: модель стала массовой. Стоит обратить внимание на вариант написания с «ы» (Комарныцкая, а не Комарницкая) — это указывает на украинское или белорусское произношение, где твёрдый звук [ы] сохраняется после «р».

В русском языке фамилия редкая, а её распространение привязано к западу Украины и югу Беларуси. Если искать параллели, то однокоренные фамилии Комар, Комаров, Комаровский образованы от того же корня, но по другой модели. Комарныцкая стоит особняком: она не про комаров, а про конкретное место, где эти комары, возможно, и водились в изобилии.