Фамилия Комарова входит в сотню самых распространённых русских фамилий, и её происхождение — один из тех случаев, когда за простым прозвищем стоит несколько разных историй.

Чаще всего фамилию образовали от прозвища Комар. В быту так могли назвать человека невысокого роста с тонким голосом, назойливого в общении или, напротив, дотошного и тщательного в работе. С комаром на Руси связывали множество примет: «Много комаров — готовь коробов (по ягоду)», «Комара нет — овса и трав не будет», «Когда появятся комары, пора сеять рожь». Давая ребёнку мирское имя Комар, родители верили, что природа примет его как своего, а к нему перейдут полезные качества этого насекомого.

Есть и вторая версия: у татар фамилия Комарова могла возникнуть от мужского имени Камар арабского происхождения. В переводе оно означает «месяц, лунный», а в переносном смысле — «лучистый, красивый, как месяц». Так что у однофамильцев могут быть совершенно разные корни.

Фамилия древняя: родственные именования встречаются в документах с XV века. В 1498 году упоминается своеземец Дмитр Комаров, в 1552-м — браславский земянин Комар Борис. В истории России известно несколько дворянских родов Комаровых. Самый старый из них внесён во II часть родословных книг Воронежской и Витебской губерний. Его основатель, Никита Комаров, подписал грамоту Москвы с Тверью при Иване III. При Иване Грозном Комаровы держались земщины, против опричнины, и один из братьев, не выдержав, ушёл в Литву, где стал графом Комаровским.

Андрей Комаров был в числе первых дворян, которых Пётр I отправил учиться за границу. Братья Виссарион и Владимир Комаровы — герои Отечественной войны 1812 года и взятия Парижа. Сын Виссариона, Константин, дослужился до генерал-лейтенанта и был комендантом варшавской крепости, а его брат Александр Виссарионович Комаров (1823—1904) участвовал в Кавказской войне и Туркестанских походах.

Другой род Комаровых берёт начало от Афанасия Комарова, который начал службу в 1769 году, а в 1787-м стал обер-секретарём Адмиралтейской коллегии. В 1790 году он получил диплом на потомственное дворянство. Герб этого рода внесён в I часть «Общего гербовника дворянских родов Всероссийской империи»: щит разделён вертикально, в правой золотой части — грушевое дерево с плодами, в левой серебряной — несколько комаров. Щит увенчан дворянским шлемом со страусовыми перьями, намёт серебряный с зелёной подкладкой.

Среди известных носителей фамилии — Николай Васильевич Комаров (1831—?), прапорщик, основатель города Владивостока, и Владимир Леонтьевич Комаров (1869—1945), ботаник и географ, президент Академии наук СССР.