Фамилия Комогорова — один из тех случаев, когда географическое название оказалось сильнее первоначального звучания. Её основа — село Холмогоры, но не в современном, а в более древнем виде. Дело в том, что до XV–XVI века поселение на Северной Двине называлось Колмогоры, и именно от этой формы пошла фамилия Колмогоров. Однако в живой народной речи плавный звук «л» в корне со временем выпал, и фамилия закрепилась в упрощённом варианте — Комогоров.

Переселенцы с русского Севера принесли эту фамилию на Урал, где она и получила широкое распространение. Интересно, что в документах XVII–XVIII веков можно встретить оба написания — и Колмогоров, и Комогоров, причём нередко у одной и той же семьи. Это говорит о том, что процесс утраты «л» шёл постепенно и не был закреплён строгой орфографией.

Само село Холмогоры — место с богатой историей. Впервые оно упоминается в летописях XIV века как новгородское владение. Здесь в конце XIV века появилась деревянная крепость, а в 1613 году выстроили кремль с пятью башнями, который выдержал осаду польско-литовских войск. С Холмогорами связан и первый в истории России морской экспорт зерна: в 1492 году отсюда в Данию отправился караван судов. Кроме того, это родина Михаила Васильевича Ломоносова, хотя его фамилия, в отличие от Комогоровых, к названию села прямого отношения не имеет.

Среди носителей фамилии — Виктор Иванович Комогоров (род. 1947), генерал-полковник, начальник службы оперативной информации и международных связей ФСБ России. Но основная масса Комогоровых — потомки тех самых северных крестьян, которые, перебравшись на Урал, сохранили в фамилии память о своей малой родине, пусть и в изменённом, обкатанном языком виде.