Фамилия Конофольская — одна из тех, что на первый взгляд кажется очевидной, но при ближайшем рассмотрении ставит перед исследователем несколько загадок. Начнём с главного: перед нами типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «название места + суффикс -ск- + окончание -ая». Такие фамилии в дворянской и духовной среде Российской империи указывали на родовое поместье или место, откуда вышел основатель рода. Однако с корнем всё сложнее.

Основа «Конофол-» не встречается в списках известных сёл и городов центральной России. Это заставляет искать объяснение в двух направлениях. Первое: искажение более распространённого топонима. Например, на Украине есть село Конотоп, но превращение «Конотопский» в «Конофольский» маловероятно фонетически. Второе: основа могла быть не славянской, а западноевропейской. В польском языке существует слово «konofol» — устаревшее обозначение конопли (от лат. cannabis). В таком случае фамилия могла возникнуть у переселенцев из Речи Посполитой и означать «та, что из Конопляного» — либо по названию хутора, где сеяли коноплю, либо по прозвищу самого владельца.

Суффикс -ск- указывает на то, что фамилия, скорее всего, принадлежала к шляхетскому или духовному сословию. В крестьянской среде такие фамилии с окончанием -ский/-ская закреплялись редко, обычно их давали при поступлении в семинарию. Если Конофольская — семинарская фамилия, то её могли «сконструировать» из латинского корня для благозвучия, что было обычной практикой в духовных училищах XIX века.

География бытования фамилии сегодня — преимущественно западные регионы России и Беларусь, что подтверждает версию о польском или западнорусском происхождении. Встречается она редко, что говорит о небольшом роде. Фамилия не меняла формы: вариант «Конофольский» для мужчин и «Конофольская» для женщин — классическая пара, где женская форма сохраняет окончание, указывающее на принадлежность к роду.