Фамилия Конусенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, один из самых распространенных в восточнославянской ономастике, особенно на Левобережной Украине, изначально имел значение «маленький» или «сын»: Конусенко буквально означает «сын Конуса» или «потомок Конуса». В основе фамилии лежит прозвище Конус.

Прозвище Конус могло закрепиться за человеком по нескольким причинам. Самая прямая — за внешнее сходство с геометрической фигурой: например, за высокую худощавую фигуру с узкими плечами или, наоборот, за плотное телосложение, сужающееся кверху. В говорах слово «конус» могло также обозначать некий остроконечный предмет, что давало повод для прозвища мастерового — скажем, токаря или резчика, работавшего с коническими деталями. Менее вероятна, но не исключена связь с профессией: в некоторых ремеслах конусом называли инструмент или деталь станка.

Модель на -енко указывает, что фамилия сложилась в среде казачества или крестьянства, где такие «патронимические» фамилии вошли в обиход в XVI–XVII веках. Географически фамилия Конусенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине, хотя встречается и в южных регионах, куда переселялись казаки. В России фамилия редка и обычно указывает на украинские корни предков.

В отличие от фамилий на -ов/-ин, которые чаще встречались у великорусского населения, Конусенко сохраняет яркий региональный колорит. Родственные по основе фамилии — Конусов, Конусовский, Конусевич — встречаются реже и в других ареалах.