Фамилия Конжафаров — редкий пример тюркско-персидского сращения, которое закрепилось в русской фамильной модели. Её основа распадается на две части: «конж» и «фар». Первая часть восходит к тюркскому «кенже» (младший, последний ребенок в семье). Вторая — к персидскому «фар» (свет, сияние, блеск) или к арабскому «фарр» (роскошь, великолепие). Вместе имя Конжафар (а именно от него образована фамилия) могло означать «младший, но сияющий» или «последний свет» — образное именование для позднего, долгожданного сына.

Модель образования проста: к восточному личному имени Конжафар добавили русский патронимический суффикс -ов. Такое оформление типично для фамилий тюркских народов, попавших в орбиту русского делопроизводства в XVI–XIX веках. Фамилия не переводилась, а записывалась на слух, поэтому возможны варианты вроде Кенжафаров или Конжапаров, но основной закрепился именно с «о» в первом слоге — под влиянием акающих говоров.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где смешивались тюркские и иранские языки: Узбекистан, Таджикистан, юг Казахстана. В России она встречается крайне редко, в основном у потомков выходцев из Средней Азии. Сословно предки Конжафаровых, скорее всего, были незнатными людьми — ремесленниками, мелкими торговцами или земледельцами, поскольку составные имена с элементом «фар» давали не столько аристократы, сколько простые семьи, желавшие подчеркнуть ценность ребёнка.

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что сохранила редкий персидский компонент «фар» на конце, который в русской среде часто переосмыслялся или усекался. Сравните с более частыми Кенжебаевыми или Кенжегуловыми — здесь «фар» выступает как смысловой акцент на свете и красоте, а не на социальном статусе или животном тотеме.