Фамилия Кораченцева — редкий случай, когда словообразовательная модель подсказывает ответ быстрее, чем анализ корня. В ней есть суффикс -ев-, но не простой, а наращённый: -енц-ев. Такая конструкция типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён с суффиксом -ец, -енц. Чаще всего это означало «сын такого-то» или «принадлежащий такому-то». То есть Кораченцев — буквально «сын Кораченца» или «человек из рода Кораченца».

Сам корень — Корач- — ведёт к двум основным версиям. Первая: диалектное слово «корач» или «корачиться» — пятиться задом, ползти на карачках, двигаться неуклюже. В некоторых говорах «корач» называли человека, который ходит сгорбившись или переваливается. Вторая версия: основа от прозвища Корач, которое давали человеку, жившему у «корача» — так в южнорусских областях иногда называли корягу, кривое дерево или изгиб реки. Менее вероятна связь с украинским «корач» (шаг), но и её полностью исключать нельзя.

Фамилия явно недворянская: суффикс -енцев встречается в крестьянской и мещанской среде, особенно в центральных и южных губерниях России. Если судить по географии бытования, Кораченцевы чаще всего встречаются в Воронежской, Ростовской областях и на Кубани — это косвенно подтверждает южнорусскую или украинскую основу прозвища. В старых метрических книгах фамилия могла писаться через «а» (Караченцев) — это не ошибка, а отражение акающего произношения.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» похожая модель разбирается на примере фамилий на -енцев, -инцев, -овцев, которые Унбегаун считает характерными для восточноукраинских и южнорусских территорий. Кораченцева — не фамилия знаменитого рода, а бытовое прозвище, закрепившееся за семьёй. Её носитель в XVIII–XIX веках с большой вероятностью был крестьянином или однодворцем, а прозвище получил от соседей за манеру ходить, жить у излучины реки или за упрямый характер — «попятился, как корач».