Фамилия Корнаковская — женская форма фамилии Корнаковский (но в современном бытовании нередко закрепляется за женщинами как неизменяемая). Её основа и суффикс указывают на географическое происхождение: типичная «топонимическая» модель на -ский/-ской, которая в XVI–XIX веках закреплялась за выходцами из конкретного места, чаще всего за дворянами, получившими фамилию по названию имения или населённого пункта. В основе фамилии лежит топоним Корнаково, Корнаковка или Корнаков — такие названия встречаются в исторических документах по Смоленской, Могилёвской, Витебской губерниям, а также на территории современной Беларуси и Польши (ср. деревни Корнаково, Корнакув). Корень «корнак» в этих названиях восходит либо к прозвищу Корнак (от древнерусского «корнать» — резать, укорачивать, то есть человек с увечьем или короткой стрижкой), либо к тюркскому «корнак» — слуга, конюх, что менее вероятно для славянской топонимики, но не исключено в зонах польско-татарских контактов.

Словообразовательная модель редкая: не -ский, а -овский. Суффикс -ов- в сочетании с -ский указывает на то, что фамилия образована не напрямую от названия села, а от фамилии владельца или более старого прозвища. То есть сначала возникло название поселения Корнаково (от прозвища Корнак), а затем по нему назвали помещика или служилого человека — Корнаковский. В отличие от фамилий вроде Смоленский или Московский, где корень — готовый топоним, здесь видна двухступенчатая цепочка: прозвище → деревня → фамилия.

В польской ономастике фамилия Корнаковский (Kornakowski) фиксируется с XVII века, в основном среди мелкой шляхты Подляшья и Мазовии. На русских землях фамилия встречается реже и часто несёт следы ополячивания или украинизации. Носительницы фамилии Корнаковская, скорее всего, происходят из западнорусских или белорусских дворянских родов, потерявших сословный статус в XIX веке, либо из крестьян, получивших фамилию по месту выхода при переписях. Единого герба или знаменитого рода под этой фамилией не зафиксировано — она остаётся локальной, без широкой известности, что типично для фамилий, привязанных к одному-двум сёлам.