Фамилия Костянниковы — редкий случай, когда угадываются сразу две возможные основы, и обе по-своему логичны. Первая и самая очевидная: Костянник — это народная, разговорная форма крестильного имени Константин (от греческого «констанс» — стойкий, постоянный). В русских говорах имя Константин нередко «укорачивали» до Костя, а от него образовывали ласкательные или обиходные варианты с суффиксом -ник: Костянник. Такой способ словообразования (имя + -ник) встречается, но не так часто, как стандартные -ов и -ин, что делает фамилию морфологически любопытной. Вторая версия — прозвище Костянник от слова «кость». В этом случае прозвище могло закрепиться за очень худым, «костлявым» человеком или, наоборот, за косторезом — мастером, работавшим с костью. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая (от имени) кажется более вероятной: в русской ономастике фамилии от крестильных имён составляют большинство, а прозвищные варианты на -ник от «кости» встречаются реже и обычно фиксируются в форме Костин или Костяев. Суффикс -ников в фамилии — притяжательный, он отвечает на вопрос «чей?»: сын Костянника, то есть Костянников. Фамилия не относится к числу распространённых, её географическая привязка размыта, но, судя по структуре, она могла возникнуть в северных или центральных русских землях, где любили развёрнутые суффиксальные формы. В любом случае, Костянниковы — это пример фамилии, которая сохранила в себе живую народную речь, где церковное имя обросло бытовым суффиксом и закрепилось в родовом прозвании.