Фамилия Костянников образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Костянников послужило церковное имя Константин. Имя Костянник, скорее всего, является производной формой мужского крестильного имени Константин, которое в переводе с греческого означает «стойкий, постоянный». Не исключено, что фамилия Костянников происходит не от имени, а от прозвища Костянник, которое восходит к нарицательному «кость». В таком случае, прозвище Костянник могло указывать на внешние особенности предка: худоба, костлявость. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Костянник, со временем получил фамилию Костянников. О точном месте и времени возникновения фамилии Костянников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Костянников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.