Фамилия Котмерова — редкий случай, где разбор начинается не с корня, а с почти прозрачной, но обманчивой конструкции. На первый взгляд, в ней слышится что-то иноязычное, возможно, тюркское или финно-угорское. Однако если присмотреться, это классическая русская фамилия, образованная по модели «прозвище + суффикс принадлежности».

Основа — «Котмер». Скорее всего, это сложное слово, где первая часть «кот» указывает на домашнее животное, а вторая — «мер» — восходит к глаголу «мерить» или к существительному «мера». Прозвище Котмер могли дать человеку с въедливым, дотошным характером, который «мерил всё по-кошачьи», то есть придирчиво, или же тому, кто занимался отмером чего-либо, но делал это нечестно, «по-кошачьи» — с хитрецой. В русских говорах слово «кот» могло означать не только животное, но и обманщика, плута (отсюда «кот в мешке»). Таким образом, Котмер — это «плутоватый мерщик» или «дотошный, как кот».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «котома» (котомка, сумка). Тогда Котмер мог быть прозвищем торговца или странника, который «мерил котомой», то есть торговал на вес. Но это предположение не имеет надёжных подтверждений в ономастике.

Суффикс «-ов» указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Котмеров. Женская форма Котмерова означает «дочь или жена Котмерова». Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, и географически тяготеет к центральным и южнорусским областям, где были распространены прозвища с корнем «кот».

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) прямого упоминания Котмерова нет, что подтверждает её редкость. Фамилия не попала в массовые списки, потому что прозвище было нестандартным: оно не просто называло человека по профессии или внешности, а давало ему сложную, ироничную характеристику. Носители фамилии, скорее всего, происходят из одной локальной группы, где это прозвище закрепилось за конкретным родом.