Фамилия Ковалышын — яркий пример того, как украинская основа обросла характерным для восточнославянских фамилий суффиксом принадлежности. Корень здесь очевиден: «коваль» — украинское и белорусское название кузнеца (от «ковати» — ковать). В русском языке этому слову соответствует «кузнец», но в украинской среде профессия кузнеца дала жизнь огромному числу фамилий: Коваль, Коваленко, Ковальчук, Ковалевский.

Особенность фамилии Ковалышын — в суффиксе «-ышын». Это не самый частый, но вполне узнаваемый патронимический формант, характерный для украинских фамилий. Он отвечает на вопрос «чей?» и означает «сын Ковалыша» или «потомок человека по прозвищу Ковалыш». Само прозвище Ковалыш — это уменьшительная или пренебрежительная форма от «коваль»: так могли называть молодого кузнеца, подмастерья или просто человека невысокого роста, работающего кузнецом. В украинском языке суффикс «-ыш» часто придаёт слову оттенок «маленький» или «младший», ср. «хлопчисько» — мальчишка.

Таким образом, вся цепочка выглядит так: профессия «коваль» (кузнец) → прозвище Ковалыш («кузнечик», «молодой кузнец») → фамилия Ковалышын («чей? — сын Ковалыша»). Географически фамилия тяготеет к западноукраинским землям, особенно к Волыни и Подолью, где суффикс «-ышын» встречается чаще, чем на востоке Украины. В России такая форма почти не встречается — там преобладают Ковалёв или Ковальчук.

С точки зрения социального происхождения, предки носителя фамилии с высокой вероятностью были ремесленниками, работавшими с металлом. Кузнецы в традиционном обществе занимали особое положение: их уважали за силу и умение, но часто побаивались, считая чуть ли не колдунами. Фамилия Ковалышын — редкий, но красноречивый документ, сохранивший в себе и профессию, и уменьшительно-ласкательный оттенок, и региональный способ образования фамилий.