Фамилия Ковшуля — редкий пример, где словообразовательный суффикс -ул(я) сам по себе даёт ключ к разгадке. В русских прозвищах этот суффикс часто придавал слову уменьшительно-пренебрежительный или, наоборот, шутливо-ласкательный оттенок. В основе лежит слово «ковш» — широкий округлый сосуд с ручкой для зачерпывания жидкостей и питья. Соответственно, Ковшуля — это не просто человек, связанный с ковшом, а скорее прозвище по характерному признаку: возможно, так дразнили того, кто любил выпить, либо мастера, который делал или продавал ковши.

С точки зрения этимологии, здесь работает модель, схожая с фамилиями вроде Гуля (от «гулять») или Вертуля (от «вертеться»). Суффикс -ул(я) в восточнославянской антропонимии встречается нечасто, что делает фамилию Ковшуля заметной на фоне более распространённых Ковшовых или Ковшевых. В отличие от патронимических фамилий на -ов/-ев, эта форма сразу указывает на прозвище, а не на имя отца.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где суффикс -ул(я) в прозвищах встречается чаще. Однако в документах XVII–XVIII веков носители фамилии Ковшуля не фиксируются в боярских списках или переписях служилых людей — это говорит о крестьянском или ремесленном происхождении. Скорее всего, предок был кузнецом-котельником или просто обладал заметной чертой, за которую и получил прозвище. Фамилия закрепилась в форме, не изменённой канцелярской унификацией, что тоже редкость.