Фамилия Кожушкина — женская форма фамилии Кожушкин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Кожушка. В основе лежит слово «кожух» — так в старину называли полушубок из овчины, тулуп, крытый кожей. Кожух был не просто верхней одеждой, а символом достатка и защиты от холода, поэтому прозвище Кожушка могли дать либо скорняку, шьющему такие тулупы, либо человеку, который постоянно ходил в кожухе и выделялся этим среди односельчан.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -к- в основе Кожушк- (уменьшительно-ласкательная форма от «кожух») плюс патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность: «сын Кожушки» или, в женском роде, «дочь или жена Кожушкина». Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены. В южных регионах чаще встречался бы вариант Кожушков.

Интересная деталь: в некоторых говорах «кожух» означал не только одежду, но и кожуру, шелуху, а также — в переносном смысле — скупого, жадного человека («всё в кожух прячет»). Однако основная версия — ремесленная или бытовая — выглядит убедительнее, потому что прозвища по роду занятий давали чаще, чем по чертам характера. Скорняки и овчинники были нужны в любом селе, и их профессия легко становилась фамилией.

Встречается фамилия Кожушкина в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает связь с ремеслом: в этих регионах издавна выделывали овчину и шили тулупы. Редкая географическая привязка — Рязанская область, где слово «кожух» сохранилось в диалектах в значении «овчинный полушубок без рукавов». Носители фамилии могли быть как крестьянами, так и посадскими людьми, но в дворянские роды она не попала — слишком бытовое прозвище.