Фамилия Крапчаткина образована от прозвища Крапчатый, а то, в свою очередь, — от прилагательного «крапчатый». У этого слова два основных значения, и каждое ведёт к разному портрету предка.

Первое значение — «покрытый мелкими пятнами, в брызгах». Такое прозвище могли дать человеку с обильными веснушками или особой отметиной на коже. Это самый прямой и частый путь возникновения фамилий «по внешности».

Второе значение — специальное, из переплётного дела. «Крапчатый» называли окраску обреза книги мелкими брызгами краски. Мастер, который наносил такой узор, вполне мог получить прозвище Крапчатый. В этом случае фамилия указывает на ремесло: предок носителя фамилии Крапчаткина был переплётчиком книг.

Суффикс -к- в основе (Крапчат-к-ин) — редкая деталь. Обычно фамилии от прилагательных образуются напрямую: Крапчатый → Крапчатов. Здесь же сначала появилось отчество Крапчатка (как уменьшительная форма от Крапчатый), а уже от него — фамилия Крапчаткин. Такая модель встречается в северных и центральных говорах, где «-ка» было обычным фамильным суффиксом для сына. Женская форма Крапчаткина — естественное окончание для этой фамилии.

География фамилии узкая: основная масса носителей встречается в Вятской губернии и соседних регионах. Словарь Б. Унбегауна не фиксирует эту фамилию, что говорит о её локальном, а не общерусском распространении. Версия с веснушками правдоподобнее ремесленной: прозвища по внешности давали чаще, чем по узкой профессии переплётчика.