Фамилия Крапчатовы (в мужском роде — Крапчатов) образована от личного прозвища, что характерно для многих русских фамилий. В основе лежит прилагательное «крапчатый». У этого слова было два основных значения, которые указывают на возможные причины появления прозвища.

Первое значение — «в мелких пятнах или брызгах», «алый, мареновый». Скорее всего, прозвище Крапчатый дали человеку с обильными веснушками или иной особенностью внешности, связанной с пятнистой окраской кожи. Второе, более редкое значение — «окраска обреза книги мелкими брызгами краски». Такой термин использовали в переплётном деле. Значит, прозвище могло указывать и на род занятий: Крапчатым называли переплётчика книг, который обрабатывал обрезы особым способом.

Фамилия образована с помощью типичного русского суффикса -ов, который присоединялся к основе прозвища, оканчивающейся на твёрдый согласный. Таким образом, Крапчатов — это потомок человека по прозвищу Крапчатый. Оба варианта — и внешностный, и профессиональный — имеют равное право на существование, но в быту прозвища по внешним приметам давались чаще.

Точное время и место возникновения фамилии установить трудно: процесс становления фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий. Однако сама основа «крап-» (от «крапать», «кропить») — древняя, общеславянская. Родственные фамилии — Крапивин, Краплин — встречаются чаще, а Крапчатов остаётся редкой: она сохранила не только прозвище, но и архаичную форму прилагательного, почти вышедшую из живого языка.