Фамилию Крапчитов можно разобрать на две части, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. Основа «крапч-» и суффикс «-итов» встречаются редко, что делает эту фамилию интересной для этимолога.

Самый вероятный корень — «крап», «крапина» — то есть пятно, точка, крап. Слово «крапчатый» в старом русском языке означало «пёстрый, в крапинку». Например, крапчатая ткань, крапчатая масть лошади или собаки. Прозвище Крапч (или Крапча) могли дать человеку с веснушками, рябому на лицо, либо тому, кто носил пёструю одежду или работал с крапчатым материалом. Суффикс «-итов» — редкий вариант патронимического суффикса «-ов» (ср. фамилии Плешитов, Космытов). Он указывает на отчество: Крапчитов — сын Крапчита. А Крапчит, в свою очередь, — обладатель прозвища Крапча (с добавлением уменьшительного суффикса «-ит»). То есть цепочка: прозвище Крапча → Крапчит (сын или внук Крапчи) → Крапчитов (потомок Крапчита).

Менее вероятная, но возможная версия — связь с профессией. В некоторых говорах «крапчить» могло означать «делать крап, наносить узор». Предок мог быть красильщиком, набойщиком тканей или даже картёжным шулером (крапленые карты). Однако для второй версии нет устойчивых диалектных подтверждений, поэтому основная гипотеза — прозвище по внешнему признаку.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и южных областях России (Воронежская, Тамбовская, Ростовская области). По сословной принадлежности носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В написании возможна путаница с фамилией Крапчиков (через «-ик-»), но Крапчитов — более архаичная форма, сохранившая редкий суффикс.