Фамилия Крацун — редкий случай, когда при взгляде на неё сразу возникает вопрос: откуда этот корень? В русском языке слова «крац» нет, и это главная зацепка. Скорее всего, фамилия имеет западнославянские или южнославянские корни, попав на русскую почву через миграцию или переселение. В польском, чешском или украинском языках «крац» (krac, kracz) может быть звукоподражательным — так передают карканье вороны или грача. Отсюда прозвище Крацун могли дать человеку с хриплым, резким голосом или, в переносном смысле, тому, кто постоянно ворчит, «каркает» на неудачи.

Другая, более конкретная версия ведёт к украинскому или белорусскому диалектному слову «крацун» — так в некоторых регионах называли коротышку, человека невысокого роста. Основа «крат-» (сравните с «короткий») дала в диалектах формы «крац», «краць», а суффикс «-ун» типичен для прозвищ по внешнему признаку (горбун, хитрун, крикун). То есть Крацун — это «коротышка», и прозвище было чисто описательным: предок был низкорослым или плотным.

Обратите внимание на суффикс. Фамилии на «-ун» в русской традиции редки и чаще встречаются на западе — в Беларуси, на Украине, в Польше. Там прозвища с этим суффиксом охотно превращались в фамилии без дополнительных окончаний (как Крикун, Скакун). В России такого типа фамилии обычно «русифицировали», добавляя «-ов» или «-ев», но Крацун сохранил исходную форму. Это говорит о том, что фамилия могла закрепиться в среде, где традиция «бессуффиксных» фамилий была сильнее, или же носители переселились в Россию уже с готовой фамилией.

Встречается Крацун и в польском контексте, где «krac» может быть вариантом слова «krak» — ворон. Польские фамилии вроде Krak, Kraczek, Kraczun известны, и Крацун может быть их фонетическим вариантом. В русских переписях фамилия фиксируется с XIX века, но крайне локально: основная зона — юго-западные губернии (Волынская, Подольская, Киевская) и прилегающие районы Беларуси. В центральной России она практически не встречается, что подтверждает её западное происхождение.

Нельзя исключать и совсем простую версию: отчество от имени Крак или Крац — уменьшительной формы от Краков (сравните с Краковяк) или от редкого канонического имени. Но имя Крац не зафиксировано в русских святцах, поэтому эта гипотеза слабее. Самое правдоподобное — прозвище по внешности или голосу, которое закрепилось за родом на западе славянского мира и в таком виде дошло до наших дней.