Фамилия Клацун — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не изменилось со временем. Она образована напрямую от аналогичного прозвища, а то, в свою очередь, — от украинского глагола «клацать». В языке у этого слова несколько значений, и каждое могло дать свою ветвь носителей.

Первое, самое прямое значение — «щелкать» или «издавать короткий отрывистый звук». Так могли прозвать человека за характерную манеру говорить, за привычку щёлкать пальцами или за то, как он работает. Но есть и более бытовые, переносные смыслы. «Клацать зубами» — это и от холода, и от голода. Поэтому прозвище Клацун нередко закреплялось за тем, кто плохо переносил морозы, или за бедняком, чей рацион был скуден и однообразен.

Третья версия, не менее весомая, — профессиональная. Если вспомнить, как звучит работа плотника или столяра: стук топора, щелчок рубанка, лёгкий перестук стамесок — всё это можно описать тем же глаголом «клацать». Так что предок-Клацун вполне мог быть мастером по дереву, причём прозвище ему дали не за качество работы, а за характерный звук инструмента.

Словообразовательная модель фамилии проста: основа «клац-» плюс суффикс «-ун». В украинской и южнорусской традиции этот суффикс часто образует прозвища по действию или характерному признаку (ср. Балакун, Скакун). То есть Клацун — это буквально «тот, кто клацает». Географически фамилия тяготеет к Украине и югу России, что подтверждается и украинским происхождением глагольной основы. В русских говорах севернее это слово встречается реже, поэтому вероятность украинских корней у носителей фамилии высока.