Фамилия Крекотень — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти без изменений перешло в фамилию. Суффикс -ень типичен для украинских прозвищ, образованных от глаголов: он указывает на носителя действия. Здесь исходное слово — украинское «кректати» («кряхтеть, стонать, охать» или «крякать, хрипло кричать»). Соответственно, Крекотень — это «кряхтун»: человек, который часто кряхтел, возможно, из-за болезни или старости.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает прозвище с хриплым голосом — если предок не кряхтел, а именно хрипло кричал или издавал звуки, похожие на утиное кряканье. Оба значения лежат в одной смысловой плоскости: прозвище описывало характерную особенность поведения или голоса.

Фамилия украинская по происхождению. На территории современной Украины она встречается в центральных и восточных областях, а также в приграничных районах России, куда переселялись носители. Окончание на -ень, а не на -енко или -ук, говорит о том, что фамилия закрепилась в форме прозвища, без дополнительных патронимических суффиксов. Это довольно архаичная модель, характерная для ранних этапов формирования украинских фамилий.

Социальный контекст: прозвище Крекотень могли дать в крестьянской или казачьей среде, где меткие и не всегда лестные прозвища были нормой. Оно не указывает на профессию или место жительства, а только на личную примету. В документах фамилия фиксируется с XIX века, но как прозвище могла бытовать и раньше.