Фамилия Крекотнев образована от прозвища или нецерковного имени Крекотень. Основа здесь — диалектный глагол «крекотать», который в южнорусских и украинских говорах означал «крякать», «издавать гортанные звуки», а также «ворчать», «брюзжать». Прозвище Крекотень могли дать человеку с хрипловатым, сиплым голосом, похожим на кряканье утки или лягушачье кваканье. Реже — ворчливому, вечно недовольному человеку.

Суффикс -ев- в фамилии указывает на притяжательное значение: «чей?» — Крекотнев, то есть сын или потомок Крекотня. Форма на -ев, а не на -ов, объясняется тем, что основа оканчивается на мягкий согласный («нь»). Это типичная модель для русских фамилий, закрепившаяся в XVI–XVII веках.

Интересно, что слово «крекотень» в некоторых говорах имело и второе значение — «коростель» (птица с характерным скрипучим криком). Если прозвище дали по птице, то оно могло быть связано с внешним сходством, повадками или даже тотемными верованиями. Но первая версия — по голосу человека — более вероятна, так как прозвища, основанные на физических особенностях, встречаются в русской антропонимии чаще, чем «птичьи».

Фамилия редкая. Основной ареал — юг России, особенно Ростовская область, Краснодарский край, а также Украина. Встречаемость в центральных областях мала. Это говорит о том, что фамилия сформировалась в среде южнорусского или украинского крестьянства, где диалектная лексика была особенно устойчива. В дворянских родословных Крекотневы не значатся — фамилия почти наверняка крестьянская или казачья.

Однокоренные фамилии — Крекотень, Крекотневский — встречаются ещё реже. В них сохранилась та же основа, но с разными суффиксами, что подтверждает единое происхождение от одного прозвищного корня.