Фамилия Крекшины — один из тех случаев, где за основу могло лечь и прозвище, и географическое название. Разберёмся по порядку.

Самое прямое объяснение — от прозвища Крекша. В северных и центральных русских говорах крекшей называли дикую утку, причём название звукоподражательное: птица издаёт характерный «крек». Прозвище могли дать охотнику, который хорошо знал повадки водоплавающей дичи, или просто человеку с хрипловатым, «уткиным» голосом. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Крекшин, то есть сын или потомок Крекши.

Вторая версия — топонимическая. В России есть две реки Крекша: одна в Ярославской области, другая в Новгородской. Кроме того, в Старорусском районе Новгородчины существует деревня Крекша. Если предок жил на берегу такой реки или был выходцем из этой деревни, он вполне мог получить прозвище по месту жительства. Такая модель образования фамилий (от названия реки или села без дополнительного суффикса) встречается реже, чем от прозвища, но для северо-западных земель Руси она характерна.

Морфологически фамилия проста: основа Крекш- плюс типичный русский суффикс -ин, указывающий на прямое родство. В документах фамилия встречается с XVII века — например, в новгородских писцовых книгах упоминаются крестьяне Крекшины. Среди однокоренных фамилий — Крекшин, Крекшев, Крекшов, но все они редки и не образуют массовых гнёзд.

Какая версия правдоподобнее? Прозвищная — проще и универсальнее: утка водится повсеместно, а вот топонимическая привязка к конкретным Крекшам сужает ареал. Впрочем, обе версии не исключают друг друга: человек мог получить прозвище по реке, на которой жил. Точный ответ даст только изучение родословной конкретной ветви Крекшиных — где жили предки, чем занимались, когда фамилия впервые зафиксирована.