Фамилия Крокунов звучит необычно, но её происхождение прозрачнее, чем кажется. В основе лежит прозвище Крокун, которое могли дать человеку с хриплым, каркающим голосом — от глагола «крокать» (каркать, издавать резкие звуки). В некоторых говорах «крокун» означало ворона или вообще крупную крикливую птицу. Так что первый носитель фамилии, скорее всего, получил её за манеру речи или голос, а не за внешность.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединился к основе Крокун, дав отчество-притяжательность («чей?» — Крокунов, то есть сын Крокуна). Это указывает на формирование фамилии в крестьянской или посадской среде, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с украинским или польским «крок» (шаг). В таком случае Крокун мог быть прозвищем ходока, скорохода или даже танцора. Но для русской ономастики птичье-звукоподражательное объяснение надёжнее — оно подтверждается диалектными словарями.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и северных областях России, где «крокать» фиксировалось как живое слово. В дворянских родословных книгах Крокуновы не значатся — фамилия явно народная, не аристократическая.

Любопытно, что в старых документах встречается вариант написания «Крокуновъ» с твёрдым знаком, а также однокоренные фамилии Крокин, Кроков — все они от тех же прозвищ. Но Крокунов выделяется именно суффиксом -ун, который в русском языке часто придаёт прозвищу оттенок постоянного действия или свойства (сравните: говорун, крикун). Так что предок носителя фамилии был, вероятно, человеком с характерной голосовой особенностью, которая и закрепилась за его потомками.