Фамилия Крупкины — одна из тех, где сразу слышна основа: «крупа». Но за этим простым словом стоит не одно, а как минимум два разных прозвища. Первое — насмешливое. Крупой в народе называли солдата, особенно отставного, который, вернувшись со службы, часто жил бедно и не имел хозяйства. Второе значение — ласковое, уменьшительное. Крупицей или Крупкой могли назвать маленького ребёнка, почти как сейчас говорят «кроха». Так что предки Крупкиных могли быть либо служивыми людьми, либо в родословной был кто-то очень маленький и хрупкий.

Фамилия образована по стандартной русской модели: прозвище Крупа (или Крупка) плюс суффикс принадлежности -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на прямое родство: «чей?» — «Крупкин», то есть сын Крупки. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежало не прозвище, а мирское имя Крупа — такие имена от названий продуктов и предметов быта в древности давали, чтобы «обмануть» злых духов.

Географически фамилия Крупкины встречается в основном в центральных и северных областях России, где было развито земледелие и оседлый быт. В южных регионах, где преобладали казачьи фамилии на -енко, она редка. Интересно, что у фамилии есть «двойники» — Крупников, Крупяников, Крупеников. Все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами: -ник обычно указывал на ремесло или занятие (например, крупяник — торговец крупой), тогда как -ин — на прозвище. Поэтому Крупкины — это не «торговцы крупой», а именно потомки человека по прозвищу Крупа.

Точное время возникновения фамилии установить сложно. Процесс закрепления прозвищ в качестве наследственных фамилий шёл несколько столетий, и Крупкины могли появиться как в XVII веке, так и позже, в XIX, когда крестьянам массово давали фамилии по документам. Важно, что написание через «ы» на конце (Крупкины) — это форма множественного числа, которая в русской традиции обозначает весь род или семью. В единственном числе фамилия звучит как Крупкин.