Фамилия Крушинина — типичная русская фамилия, образованная по модели «прозвище + суффикс -ин». Суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что основа фамилии оканчивалась на -а или -я: прозвище Крушиня дало Крушинина. Это одна из самых распространённых моделей в северных и центральных областях России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге.

В основе прозвища Крушиня лежит слово «крушина» — кустарник с ломкими ветвями и корой, которую использовали как слабительное и рвотное средство. В народной медицине крушина была известна хорошо, поэтому прозвище мог получить либо человек, живший в зарослях этого кустарника, либо знахарь, собиравший кору. Вторая версия связывает прозвище с польским словом «kruszec» (руда), что выводит на профессию рудокопа или плавильщика. Эта гипотеза слабее: для центральной России польское заимствование маловероятно в качестве прямого источника прозвища, а вот для западных регионов — возможно.

Интересно, что фамилия Крушинина встречается в основном в Вологодской и Архангельской областях, где крушина растёт повсеместно, а народная медицина была развита. Это косвенно подтверждает «растительную» версию. Двойной суффикс — -ин-ин — в фамилии Крушинина необычен: он возник потому, что основа Крушин- (от Крушиня) уже содержала -ин, и при добавлении фамильного -ин получился повтор. Такое встречается редко и делает фамилию узнаваемой.

Таким образом, Крушинина — фамилия, которая прямо ведёт к прозвищу предка: скорее всего, к знахарю или человеку, чей дом стоял у крушиновых кустов. В любом случае, она хранит память о русском быте, народной медицине и местной географии.