Фамилия Крушинова образована от мужской формы Крушинов, и её основа — слово «крушина». В русских говорах крушиной называют хрупкое ломкое дерево или кустарник (крушина ломкая), а также, в переносном смысле, нечто ветхое, ненадёжное или человека, который легко «ломается» под обстоятельствами. Однако есть и другая, более прозаичная версия: прозвище Крушина мог получить тот, кто занимался дроблением, толчением чего-либо — например, работал на крупорушке или толок зерно в ступе. Глагол «крушить» (дробить, разбивать) дал прямое указание на род занятий, и фамилия могла закрепиться за мельником или ремесленником, связанным с переработкой твёрдых материалов.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Крушинов — буквально «сын Крушины». Интересно, что фамилия Крушинов встречается реже, чем её вариант Крушинин, образованный от той же основы, но через суффикс -ин (по принципу принадлежности: «чей?» — Крушинин). Разница в суффиксах могла возникнуть из-за региональных особенностей: -ов чаще характерен для северных и центральных областей России, а -ин — для южных и западных.

Географически фамилия Крушинов фиксируется преимущественно в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Кировской области. В этих местах слово «крушина» в значении «ломкий кустарник» было широко употребительно, а прозвища по растениям давали людям с хрупким телосложением или ломким характером. Встречается фамилия и в украинском варианте Крушинів, но там ударение смещается, и основа может восходить к топониму Крушина (название села).

Ономастический словарь Б. Унбегауна относит фамилию к группе «растительных» прозвищ, но без привязки к конкретному сословию. Крушиновыми могли быть и крестьяне, и посадские люди — фамилия не элитарная, а бытовая, что типично для прозвищ, данных по внешности или занятию. Социального статуса по ней не определить: в ревизских сказках XVIII–XIX веков встречаются как государственные крестьяне Крушиновы, так и мещане.