Фамилия Кряхтунов — яркий пример того, как русская фамилия может родиться из звукоподражания. В её основе лежит глагол «кряхтеть» — издавать глухие, натужные звуки, обычно при физическом усилии, боли или недовольстве. Соответственно, Кряхтун — это прозвище человека, который часто кряхтел: либо по причине старческой немощи, либо из-за тяжелой работы, либо ворчливого характера. В ономастике такие прозвища называют «физиологическими» — они описывали заметную внешнюю черту или манеру поведения.

Обратите внимание на суффикс -ун-. В русском языке он продуктивен при образовании имён деятеля от глаголов: бегун, ворчун, говорун, и в данном случае — кряхтун. Этот суффикс придаёт прозвищу оттенок постоянного, привычного действия: не тот, кто однажды крякнул, а кто кряхтит постоянно. Далее по стандартной модели фамилия образовалась с помощью патронимического суффикса -ов, который отвечал на вопрос «чей?»: сын Кряхтуна — Кряхтунов.

Версия о тюркском или финно-угорском происхождении фамилии маловероятна. Слово «кряхтеть» — исконно славянское, общеупотребительное, а структура «глагольная основа + -ун + -ов» — одна из самых типичных для русских фамилий (ср. Ворчунов, Бурчунов, Шептунов). Поэтому искать экзотические корни здесь излишне.

Интересно, что фамилия Кряхтунов встречается реже, чем однокоренные Крячко или Крякин, но при этом сохраняет яркую звуковую выразительность. В дореволюционных переписях носители такой фамилии чаще всего фиксировались в центральных и северных губерниях России, где диалектное «кряхтеть» было особенно распространено. Сословный состав, вероятно, был преимущественно крестьянским или мещанским — прозвища такого типа редко давали дворянам.