Фамилия Кряктунова — женская форма фамилии Кряктунов, и её разбор стоит начать с необычной, почти звукоподражательной основы. В русских фамилиях редко встречается сочетание «кряк-», которое сразу отсылает к глаголу «крякать» (издавать звук, похожий на утиный). Однако напрямую выводить фамилию из подражания птице было бы слишком просто: в основе скорее лежит прозвище Кряктун, образованное по той же модели, что «говорун», «молчун» или «ворчун». Суффикс -ун в русских прозвищах указывает на человека, склонного к какому-либо действию или обладающего характерным качеством. Кряктун — тот, кто крякает, то есть человек с хриплым, сиплым или отрывистым голосом, возможно, с привычкой покашливать или издавать гортанные звуки. Такие прозвища давали не в обиду, а как меткую бытовую характеристику.

Морфологически фамилия Кряктунов — типичная патронимическая модель на -ов, то есть «чей?» — сын Кряктуна. В отличие от более частых фамилий на -ин (от основ на -а/-я), форма на -ов здесь закономерна, так как прозвище Кряктун оканчивается на твёрдый согласный. Интересно, что в современных русских фамилиях почти не встречается вариант Кряктунов с ударением на первый слог (Кряктунов) — ударение устойчиво падает на второй слог: Крякту́нов. Это косвенно подтверждает, что основа — не от «кряквы» (дикой утки), а от глагольной формы с суффиксом -ун, где ударение типично для таких образований (ср. болту́н, ворчу́н).

Географически фамилия редкая и, по данным открытых телефонных справочников и баз переписи, встречается в основном в центральных и южных областях России, с некоторым числом носителей в Поволжье. В дореволюционных метрических книгах фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем закреплении — скорее всего, в XIX веке у крестьян или мещан, не имевших наследственных фамилий ранее. В дворянской среде такая «звуковая» фамилия не встречается.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Кряков, Крякин, Крячко) показывает, что Кряктунов стоит особняком: у неё нет параллелей с суффиксом -тун в других русских фамилиях. Это уникальная словообразовательная модель, что делает фамилию ценной для ономастов: она сохранила редкое прозвище, которое в живой речи почти исчезло. Если бы не фамилия, мы бы вряд ли узнали, что в русских деревнях кого-то называли Кряктуном — человеком с «крякающим» голосом.