Фамилия Крякунова — женская форма от Крякунов, и разобрать её стоит с неожиданной стороны: с суффикса. Подавляющее большинство русских фамилий на -ов/-ев образованы от полных прилагательных или прозвищ на -ой/-ый (Толстой — Толстов). Крякунов же держится на суффиксе -ун-, который в русском языке активен в прозвищах по действию: крикун, ворчун, хвастун. Основа та же: «крякать» — издавать гортанный звук, характерный для уток, лягушек, а в переносном смысле — для человека с хрипловатым, сиплым голосом. Значит, Крякун — это не тот, кто крякает буквально, а человек с узнаваемой, «крякающей» манерой говорить, возможно, из-за болезни, привычки или профессии.

Модель проста: прозвище Крякун (с активным суффиксальным окончанием -ун) → притяжательное прилагательное Крякунов («чей? — сын Крякуна») → фамилия. Такая цепочка типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда прозвища давали не по отцу, а по личной черте. В словаре древнерусских прозвищ С. Б. Веселовского встречаются однокоренные «Кряк» и «Крякуша», что подтверждает: корень был в ходу в разных регионах, особенно на севере и северо-востоке Руси.

Географически Крякуновы чаще фиксируются в Вологодской, Кировской и Архангельской областях — зонах, где охота на водоплавающую дичь и рыболовство были основой быта. В этих местах прозвище могло закрепиться за человеком, который подражал утке для приманки (охотник-манщик) или за тем, кто просто «крякал» в разговоре. Сословно фамилия не элитарная: крестьяне, ремесленники, охотники — никаких князей или бояр с таким корнем не известно.

Иногда в интернете встречается версия, что Крякунов — это «кряковый» (связанный с кряквой, дикой уткой) и фамилия образована от названия птицы. Это ошибка: от «кряква» по правилам получилось бы Кряквин или Кряквенков. Суффикс -ун- указывает именно на деятеля, а не на предмет. Так что предок носительницы фамилии — почти наверняка человек, которого в деревне запомнили по голосу: хрипловатому, резкому или необычному.