Фамилия Кудесина — женская форма мужской фамилии Кудесин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или мирским именем Кудеса. Разбираем словообразовательную модель: основа «кудес-», суффикс «-ин», указывающий на принадлежность («чей?» — Кудесин, то есть сын или потомок Кудесы). Мужская форма закрепилась в документах, а женская — это форма жены или дочери Кудесина, которая в современном быту стала самостоятельной фамилией.

Корень «кудес-» в русском языке связан с понятием «чуда», «волшебства», «колдовства». Слово «кудеса» (или «кудес») в древнерусском означало «чары», «волшебство», а «кудесник» — колдун, чародей. Соответственно, прозвище Кудеса могли дать человеку, который занимался знахарством, ворожбой, или же тому, кого считали необычным, странным, «с чудинкой». В народной среде такие прозвища не несли резко отрицательного оттенка — скорее указывали на человека, обладающего тайными знаниями или нестандартным поведением.

С точки зрения региональной привязки, фамилия Кудесин (и её формы) встречается преимущественно в северных и центральных областях России, а также в Поволжье. Это объясняется тем, что в этих местах дольше сохранялись дохристианские имена и прозвища, не вытесненные церковным календарём. В словаре древнерусских личных имён С. Б. Веселовского упоминается прозвище Кудес, от которого и пошли подобные фамилии. Важно отметить, что фамилия Кудесина не является дворянской или аристократической — это типичная крестьянская или посадская фамилия, образованная от прозвища.

У фамилии есть редкая особенность: она могла возникнуть и от гидронима или топонима, но это маловероятно. Основная и самая правдоподобная версия — прозвищная, от «кудес». Поэтому предки носительницы фамилии Кудесина, скорее всего, были людьми, которых в деревне считали «кудесниками» — знахарями, ведунами или просто людьми с необычной судьбой. Никаких известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что только подтверждает её народное, неэлитарное происхождение.