Фамилия Кудишкин — памятник не столько письменности, сколько живому языку, где полные церковные имена «обкатывались» до неузнаваемости. В основе лежит крестильное имя Акиндин (от греческого akindynos — «безопасный»). В быту громоздкое Акиндин сократили до Кудима, а ласкательная форма Кудишка дала начало фамилии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Кудишкин, то есть сын или потомок Кудишки.

Интересно, что в русских говорах слово «кудишка» могло означать и нечто мелкое, неказистое (от «кудый» — плохой, худой). Однако для фамилии более надёжным выглядит именно антропонимический путь — от имени. Слишком уж устойчива цепочка Акиндин → Кудим → Кудишка, хорошо известная ономастам. Полные имена вроде Акиндина редко переходили в фамилии без сокращения, а вот народные формы вроде Кудишки — постоянно.

География фамилии неширокая: Кудишкины встречаются в центральных и северных областях России, где было распространено имя Акиндин и его производные. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — скорее всего, предки относились к крестьянам или посадским людям, получившим фамилию по деду или отцу уже после отмены крепостного права. О точном месте и времени возникновения говорить сложно, процесс формирования шёл постепенно, но сама фамилия — живое свидетельство того, как греческое «безопасный» превратилось в русского Кудишку.