Оно ведет свое начало от нарицательного «кукса» - «кулак, сжатая ладонь». Вероятно, прозвище отражало особенности характера и поведения основателя фамилии (сила, воля, упорство). Кроме того, в новгородских говорах кукса — это «пирог с кашей». В таком случае прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность предка: он мог быть поваром. Возможно также, что прозвище связано с глаголом «кукситься» - «хмуриться», «плакать», «быть в плохом настроении». Тогда Куксой называли угрюмого, невеселого человека.