Фамилия Кукшегорова — редкий пример, где географическая привязка спорит с личным прозвищем, и обе версии имеют право на жизнь. Сразу заметим: это женская форма, а мужская — Кукшегоров. Основа фамилии — слово «кукшегор» или «кукшигор», которое может быть сложным (из двух корней) или переосмысленным.

Первая и самая вероятная версия — топонимическая. В русском ономастиконе есть фамилии, образованные от названий деревень и сёл, заканчивающихся на «-гора». «Кукша» — это диалектное название птицы (сойки, реже кукушки), а «гора» — возвышенность. Значит, Кукшегор — это человек с Кукши-горы, то есть из населённого пункта, где водилось много соек или кукушек. Такие названия типичны для северных и центральных областей России (Архангельская, Вологодская, Костромская). В этом случае фамилия — чисто географическая, указывающая на место, откуда родом предок.

Вторая версия — от прозвища. Суффикс «-гор» в русских прозвищах встречается редко, но возможен. «Кукша» в некоторых говорах означало не только птицу, но и нелюдимого, угрюмого человека (ср. «кукситься»). Тогда «Кукшегор» могло быть прозвищем человека, который «горевал» или «горемычил» — жил на горе, в переносном смысле. Однако это построение искусственнее: скорее всего, прозвище было бы просто «Кукша», а «Кукшегор» — уже производное от названия места.

Модель образования простая: основа (топоним или прозвище) + суффикс -ов- (притяжательный, указывающий на принадлежность роду). Фамилия типично русская, патронимическая по форме, но не по сути — она не от имени отца, а от места или прозвища. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Кукшего́рова.

В ономастических словарях эта фамилия не зафиксирована как широко известная, что подтверждает её локальный, возможно, даже исчезающий характер. Носители встречаются в основном в Центральной России и на Урале — там, куда мигрировали северные крестьяне. Сословно — почти наверняка крестьянское происхождение: дворянские роды с таким окончанием («-горов») практически не встречаются.

Итог: фамилия Кукшегорова говорит о том, что предок жил на горе, где водились сойки (кукши), или в деревне с таким названием. Это редкий случай, когда птица и ландшафт слились в одной фамилии, не потеряв прозрачности для этимолога.